Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Mrpl28Q9D1B9 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Mrpl28Q9D1B9 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Mrpl28Q9D1B9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Mrpl28Q9D1B9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Mrpl28Q9D1B9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Mrpl28Q9D1B9 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Mrpl28Q9D1B9 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Mrpl28Q9D1B9 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Mrpl28Q9D1B9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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