Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gtf2e1Q9D0D5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms