Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUN6

Smurf1, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF1, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf1Q9CUN6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Smurf1Q9CUN6 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms