Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Cbfa2t3-203ENSMUST00000127984 7645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms