Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rpa3Q9CQ71 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rpa3Q9CQ71 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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