Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Rpl17Q9CPR4 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms