Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pramel1Q99MW3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms