Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CsprsQ99388 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms