Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cabp4Q8VHC5 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms