Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Fam20bQ8VCS3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Fam20bQ8VCS3 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Fam20bQ8VCS3 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Fam20bQ8VCS3 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Fam20bQ8VCS3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Fam20bQ8VCS3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
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Fam20bQ8VCS3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Fam20bQ8VCS3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
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