Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Dnajc28Q8VCE1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Dnajc28Q8VCE1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Dnajc28Q8VCE1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
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