Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Pitrm1Q8K411 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms