Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ssh3Q8K330 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ssh3Q8K330 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ssh3Q8K330 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ssh3Q8K330 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Ssh3Q8K330 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Ssh3Q8K330 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Ssh3Q8K330 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Ssh3Q8K330 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms