Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFI2

Cdc34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc34Q8CFI2 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Cdc34Q8CFI2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
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