Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms