Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J6

Sowahc, Ankyrin repeat domain-containing protein SOWAHC, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SowahcQ8C0J6 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SowahcQ8C0J6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SowahcQ8C0J6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SowahcQ8C0J6 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SowahcQ8C0J6 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SowahcQ8C0J6 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SowahcQ8C0J6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SowahcQ8C0J6 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SowahcQ8C0J6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SowahcQ8C0J6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SowahcQ8C0J6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SowahcQ8C0J6 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
SowahcQ8C0J6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Zfp966-202ENSMUST00000109018 733 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Zfp968-202ENSMUST00000109048 733 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SowahcQ8C0J6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms