Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX10

Pgam5, Serine/threonine-protein phosphatase PGAM5, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgam5Q8BX10 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Pgam5Q8BX10 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms