Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIF2

Rbfox3, RNA binding protein fox-1 homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbfox3Q8BIF2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Rbfox3Q8BIF2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms