Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Htatsf1Q8BGC0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Htatsf1Q8BGC0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Htatsf1Q8BGC0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Htatsf1Q8BGC0 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Htatsf1Q8BGC0 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Htatsf1Q8BGC0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms