Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFX1

Rnf187, E3 ubiquitin-protein ligase RNF187, mousemouse

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Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf187Q8BFX1 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rnf187Q8BFX1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rnf187Q8BFX1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rnf187Q8BFX1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Rnf187Q8BFX1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf187Q8BFX1 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf187Q8BFX1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf187Q8BFX1 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Rnf187Q8BFX1 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rnf187Q8BFX1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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