Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Dsg1cQ7TSF0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Dsg1cQ7TSF0 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms