Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Actn1Q7TPR4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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