Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rnf139Q7TMV1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rnf139Q7TMV1 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms