Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm7985-201ENSMUST00000183329 981 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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NipblQ6KCD5 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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NipblQ6KCD5 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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NipblQ6KCD5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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NipblQ6KCD5 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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NipblQ6KCD5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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NipblQ6KCD5 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
NipblQ6KCD5 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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