Protein–RNA interactions for Protein: Q6AXC6

Ddx11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, mousemouse

Predictions only

Length 880 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx11Q6AXC6 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm45071-201ENSMUST00000205353 571 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Pafah1b1-ps2-201ENSMUST00000207209 1223 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ddx11Q6AXC6 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms