Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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AtrxQ61687 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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AtrxQ61687 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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AtrxQ61687 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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AtrxQ61687 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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AtrxQ61687 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
AtrxQ61687 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
AtrxQ61687 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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