Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
BcanQ61361 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms