Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc6a4Q60857 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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