Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Traf3Q60803 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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