Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syne3Q4FZC9 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syne3Q4FZC9 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms