Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc9Q3V038 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc9Q3V038 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms