Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Gm6899Q3USS0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
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