Protein–RNA interactions for Protein: Q3US17

Znf48, Zinc finger protein 48, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf48Q3US17 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Scgb2a2-201ENSMUST00000179814 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
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Znf48Q3US17 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Znf48Q3US17 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
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