Protein–RNA interactions for Protein: Q3URE1

Acsf3, Acyl-CoA synthetase family member 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsf3Q3URE1 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Acsf3Q3URE1 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Acsf3Q3URE1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Acsf3Q3URE1 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms