Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR9

Sbspon, Somatomedin-B and thrombospondin type-1 domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsponQ3UPR9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
SbsponQ3UPR9 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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SbsponQ3UPR9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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SbsponQ3UPR9 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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SbsponQ3UPR9 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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SbsponQ3UPR9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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SbsponQ3UPR9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
SbsponQ3UPR9 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms