Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Washc4Q3UMB9 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms