Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttll12Q3UDE2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms