Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Rnf180Q3U827 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rnf180Q3U827 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rnf180Q3U827 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rnf180Q3U827 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rnf180Q3U827 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Rnf180Q3U827 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf180Q3U827 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rnf180Q3U827 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rnf180Q3U827 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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