Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
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