Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm16337-201ENSMUST00000160368 917 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Olfr938-201ENSMUST00000056499 1190 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rnf40Q3U319 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rnf40Q3U319 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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