Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Pnpla6Q3TRM4 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pnpla6Q3TRM4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms