Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ctdnep1Q3TP92 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Ctdnep1Q3TP92 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ctdnep1Q3TP92 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ctdnep1Q3TP92 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Ctdnep1Q3TP92 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ctdnep1Q3TP92 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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