Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim43aQ3TL54 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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