Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ttc39dQ0VF76 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Ttc39dQ0VF76 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ttc39dQ0VF76 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ttc39dQ0VF76 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ttc39dQ0VF76 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ttc39dQ0VF76 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ttc39dQ0VF76 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ttc39dQ0VF76 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Ttc39dQ0VF76 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc39dQ0VF76 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Ttc39dQ0VF76 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ttc39dQ0VF76 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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