Protein–RNA interactions for Protein: Q0MW30

Neurl1b, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, mousemouse

Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1bQ0MW30 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Neurl1bQ0MW30 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms