Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ttc21bQ0HA38 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms