Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Cnn1Q08091 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Cnn1Q08091 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms