Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cntn3Q07409 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Cntn3Q07409 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cntn3Q07409 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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