Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
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Sh3bp2Q06649 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Sh3bp2Q06649 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Sh3bp2Q06649 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Sh3bp2Q06649 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Sh3bp2Q06649 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Sh3bp2Q06649 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Sh3bp2Q06649 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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