Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scg2Q03517 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Scg2Q03517 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms